Forschung für den Mittelstand - Die IGF-Projektdatenbank

Sequenzieren am Point-of-Care am Anwendungsbeispiel SARS-CoV-2

Das Ziel von COVID-SpiNGS ist den breiten Einsatz von Next Generation Sequencing (NGS) für die Virusdiagnostik patientennah direkt am Point-of-Care zu ermöglichen. Dafür soll ein System entwickelt werden, welches den kompletten Prozess der NGS-basierten Diagnostik von der Probennahme, der Probenaufbereitung mittels zentrifugaler Mikrofluidik über das NGS bis hin zur bioinformatischen Analyse und Erstellung eines diagnoseunterstützenden Berichts automatisiert. Validiert wird dieses System durch die Analyse von 50 COVID-19 Patientenproben (Vergleich automatisierter Workflow zu manuell durchgeführtem Workflow). Durch das COVID-SpiNGS System wird die Etablierung einer über die Arztpraxen verteilten schnellen, effizienten und generischen Infrastruktur für die Diagnose einer Viruserkrankung inklusive der Bestimmung der genauen Mutation des Virus vorbereitet. Neben den Vorteilen im Alltagsbetrieb ermöglicht dies insbesondere in Ausbruchssituationen (wie in der Corona-Pandemie) Diagnosekapazitäten in kürzester Zeit mittels Software-Update um die Fähigkeit, weitere Krankheitserreger zu detektieren, zu erweitern.

Grundsätzlich ist die eigentliche Sequenzierung mittels NGS durch Geräte und Technologien von großen Firmen abgedeckt. Die Steigerung der Wettbewerbsfähigkeit für KMU durch die Förderung dieses Vorhabens erfolgt insbesondere durch die Probenvorbereitung für das Sequenzieren und die Datenverarbeitung nach Abschluss der Sequenzierung. In beiden Themengebieten besteht ein großer Bedarf an robusten und effizienten Lösungen und sie sind bisher noch nicht zufriedenstellend von großen Firmen abgedeckt. Von den angestrebten Forschungsergebnissen würden somit insbesondere folgende Branchen profitieren: Anbieter von Werkzeugbau und Kunststofftechnik, Hersteller von Produktionsmaschinen, Hersteller von Reagenzien und Assayhersteller, Dienstleister für molekularbiologische Diagnostik, Softwareunternehmen.